国立交通大学生物科技学系隶属于生物科技学院，提供基础与应用并重之生物科技教学研究。生物科技系成立于民国八十三年，由硕士班开始，成为交通大学第一个生物科技相关的系所。1998年博士班成立后，于1999年正式招收第一届大学部学生。成立宗旨为培育具有跨领域生物科技学能和技术的学术与产业人才。

主要的专业学科与研究领域包括基因体和蛋白质体学、蛋白质与酵素工程学、生物有机及无机药物化学、医学与工业微生物学、生物资讯与系统生物学、生物电子与生物感测及生物工程等等。

根据教授专长不同，目前有下列研究室

交通大学并没有医学院，但是透过与阳明大学、荣民总医院的合作，生物医学研究所成立在即，并与其它学院共同开发生物光电研究所、蛋白质酵素工程研究所、生物材料研究所等。也曾对于与电机资讯跨领域科结合做过研究。

毕业出路

根据1111人力银行所做37笔样本的统计显示，此系毕业者第一份工作大多从事员研究助理、生物科技研发人员、国内业务人、助教等职务，而第二份工作从事研究助理和生物科技研发人员的比例下降，转入各行各业。

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