科，指的是高级职业学校、专科学校与工业学院的教学单位；系，广义而言指的是大学、学院、科技大学、技术学院内的教学单位，狭义而言则只单指科技大学、技术学院之教学单位；而学系则特指大学或学院的教学单位，科技大学与技术学院之教学单位则不得称作学系。科与系经常连称，用于称呼高职、专科学校、大学、学院、科技大学与技术学院内的教学单位。近年来被教育部所引进的学位学程之制度，由于所提供之学位与课程与一般科系无异，因此口语中的科系也经常包含学位学程。

在大学与科技大学之中，每三个性质相近之科系可组成一间学院；学院与技术学院之内性质相近的科系，则可组成一个学群。科系之下可依照科系性质设立相关的分组，如应用外语系之下可能会有英语组和日语组。

本条目列出了台湾现时各大专院校的科系。