花莲清真寺，是一座位于台湾花莲县花莲市的逊尼派伊斯兰教清真寺，也是台湾第9座、花莲县第1座清真寺，于2018年3月18日由印尼前法律与人权部（英语：Ministry of Law and Human Rights (Indonesia)）部长穆罕默德·马哈福（英语：Mahfud MD）主持落成仪式。2019年11月10日，花莲清真寺在大厅设置资讯站与申诉处，服务当地的印尼在台移工。